• RNK ma’lumotlar bazalari
  • Aminokislotalar / oqsillar ma’lumotlar bazalari
  • Protein ketma-ketligi ma’lumotlar bazalari
    		•

    Fenotip ma’lumotlar bazalari




    Download 1,73 Mb.
    bet14/18
    Sana17.02.2024
    Hajmi1,73 Mb.
    #158021
    1   ...   10   11   12   13   14   15   16   17   18
    Bog'liq
    Biologik ketma-ketlikni taqqoslash. Gomologik ketma-ketliklar

    Zebrafish axborot tarmog‘i: bu baliq modeli organizmining genomi

    Fenotip ma’lumotlar bazalari


    PHI-bazasi: patogen-xost o‘zaro ta’siri ma’lumotlar bazasi. U gen ma’lumotlarini ularning xostlarida mikrobial patogenlarning fenotipik ma’lumotlari bilan bog‘laydi. Ma’lumotlar ko‘rib chiqilgan adabiyotlardan qo‘lda tanlanadi.
    RGD Rat Genom ma’lumotlar bazasi: Rattus norvegicus uchun genomik va fenotip ma’lumotlari
    PomBase ma’lumotlar bazasi: Schizosakcharomyces pombe xamirturushi uchun qo‘lda tuzilgan fenotipik ma’lumotlar

    RNK ma’lumotlar bazalari


    Taksonomik fokusli rRNK ma’lumotlar bazalari uchun #Taksonomik ma’lumotlar bazalariga qarang.
    miRBase: mikroRNK ma’lumotlar bazasi
    PolymiRTS: taxminiy mikroRNK maqsadli saytlarida DNK o‘zgarishlarining ma’lumotlar bazasi
    PolyQ: kasallik va kasallik bilan bog‘liq bo‘lmagan oqsillarda poliglutamin takroriy ma’lumotlar bazasi
    Rfam: RNK oilalarining ma’lumotlar bazasi

    Aminokislotalar / oqsillar ma’lumotlar bazalari


    Protein bilan bog‘liq ma’lumotlarni, biologik bilimlarni kashf qilishni va ma’lumotlarga asoslangan gipotezalarni yaratishni qo‘llab-quvvatlash va boshqarish uchun bir nechta ommaviy ma’lumotlar omborlari va resurslari ishlab chiqilgan. Quyidagi jadvaldagi ma’lumotlar bazalari Nuklein kislotalari tadqiqoti (NAR) ma’lumotlar bazasi masalalari va ma’lumotlar bazasi to‘plamida sanab o‘tilgan ma’lumotlar bazalari va UniProtKB da o‘zaro havola qilingan ma’lumotlar bazalaridan tanlangan. Ushbu ma’lumotlar bazalarining aksariyati UniProt / UniProtKB bilan o‘zaro bog‘langan, shuning uchun identifikatorlarni bir-biriga solishtirish mumkin.



    Protein ketma-ketligi ma’lumotlar bazalari


    DisProt: oqsillar buzilishining eksperimental dalillari bazasi (Indiana universiteti tibbiyot fakulteti, Templ universiteti, Padua universiteti)
    InterPro: oqsillarni oilalarga ajratadi va domenlar va saytlar mavjudligini taxmin qiladi

    Download 1,73 Mb.
    1   ...   10   11   12   13   14   15   16   17   18




    Download 1,73 Mb.